防护一：防高温温度过高，种子呼吸作用旺盛，会过多消耗自身贮存的营养，降低发芽率，因此要求贮藏种子的环境和温度最好在10℃左右，切忌把种子放在火炉较近的地方。
防护二：防污染种子贮藏要彻底清除作物茎叶、杂草、砂子、土粒等杂物，并对贮藏室以及贮藏用具进行严格的消毒，以免种子在贮藏过程中受到污染。
防护三：防霉变关键是控制种子本身所含的水分。禾谷类作物种子含水量为12%～13%，油料作物种子为8%～9%，若含水量过高，则易发生霉变，尤其是花生、大豆、玉米等含油脂和淀粉较多的作物种子，更应注意。
防护四：防腐蚀种子不能与农药、化肥等同室存放，因许多农药和化肥具有较强的挥发性，挥发出的气体对种子细胞和种胚危害极大。
防护五：防混杂不少作物的种子与一般食用粮食不易区分，稍不注意就会造成种、粮混杂，很容易将种子当粮食吃掉，会造成非常大的浪费；也非常容易把粮食当种子播种，引起严重减产。
防护六：防虫鼠害虫和老鼠不仅直接吃掉种子，而且还会污染种子，使种子变质，降低发芽率。因此，要采取一定的措施消灭害虫和老鼠。
防护七、防熏烟种子较长时间受到烟气熏蒸，会降低种子活性，削弱发芽率。因此烟气（尤其是煤烟气，柴草烟气）较大的房间（例如厨房）不能存放种子，贮藏室也不宜靠近厨房。
防护八：防窒息种子不能用塑料袋贮存，因塑料袋不透气，种子在袋内被迫进行无氧呼吸，产生酒精和有机酸等有毒物质，杀死种胚，使种子失去发芽能力，同时还引起霉变。
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